Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPUQ71F23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms