Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
XIRP1Q702N8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
XIRP1Q702N8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
XIRP1Q702N8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
XIRP1Q702N8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
XIRP1Q702N8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
XIRP1Q702N8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
XIRP1Q702N8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms