Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYDE1Q6ZW31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms