Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
FGD6Q6ZV73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FGD6Q6ZV73 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FGD6Q6ZV73 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms