Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPGS1Q6ZTW0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPGS1Q6ZTW0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms