Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHISA6Q6ZSJ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHISA6Q6ZSJ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHISA6Q6ZSJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHISA6Q6ZSJ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHISA6Q6ZSJ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHISA6Q6ZSJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA6Q6ZSJ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHISA6Q6ZSJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms