Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN12Q6ZSI9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms