Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM72Q6ZMU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM72Q6ZMU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms