Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNI2Q6ZMN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms