Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00114Q6XXX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 474.7 ms