Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms