Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LARP1Q6PKG0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LARP1Q6PKG0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LARP1Q6PKG0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms