Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP4Q6PIL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms