Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA3EQ6PEY2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3EQ6PEY2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms