Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD3Q6PCD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms