Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4H8

FAM173B, Protein FAM173B, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM173BQ6P4H8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FAM173BQ6P4H8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM173BQ6P4H8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM173BQ6P4H8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms