Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC27A4Q6P1M0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A4Q6P1M0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A4Q6P1M0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms