Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF544Q6NX49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF544Q6NX49 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms