Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD2Q6NTF9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD2Q6NTF9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD2Q6NTF9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms