Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC70Q6NSX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms