Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP8Q6NSW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP8Q6NSW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms