Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RCSD1Q6JBY9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCSD1Q6JBY9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.4 ms