Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTRHD1Q6GMV3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTRHD1Q6GMV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTRHD1Q6GMV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTRHD1Q6GMV3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTRHD1Q6GMV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTRHD1Q6GMV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms