Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
REP15Q6BDI9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REP15Q6BDI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms