Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A4Q6AI14 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A4Q6AI14 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms