Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
C9orf84Q5VXU9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
C9orf84Q5VXU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
C9orf84Q5VXU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms