Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM208BQ5VWN6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM208BQ5VWN6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM208BQ5VWN6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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