Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF18Q5VWM3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF18Q5VWM3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF18Q5VWM3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF18Q5VWM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF18Q5VWM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF18Q5VWM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRAMEF18Q5VWM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms