Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT2Q5VUG0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT2Q5VUG0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms