Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DIPQ5VU43 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DIPQ5VU43 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DIPQ5VU43 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms