Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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