Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RPRD2Q5VT52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RPRD2Q5VT52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RPRD2Q5VT52 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RPRD2Q5VT52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms