Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKAP1Q5VSY0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKAP1Q5VSY0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms