Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BEND3Q5T5X7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BEND3Q5T5X7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
BEND3Q5T5X7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms