Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4J0

GCNT6, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT6Q5T4J0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT6Q5T4J0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT6Q5T4J0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms