Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HIVEP3Q5T1R4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIVEP3Q5T1R4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms