Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP70Q5T0N1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFAP70Q5T0N1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms