Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHYHD1Q5SRE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHYHD1Q5SRE7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms