Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FFAR4Q5NUL3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FFAR4Q5NUL3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FFAR4Q5NUL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FFAR4Q5NUL3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FFAR4Q5NUL3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FFAR4Q5NUL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FFAR4Q5NUL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms