Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO47Q5MNV8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms