Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHC1Q5JVL4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHC1Q5JVL4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHC1Q5JVL4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms