Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF542PQ5EBM4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms