Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAVIN4Q5BKX8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN4Q5BKX8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAVIN4Q5BKX8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAVIN4Q5BKX8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms