Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KHDC3LQ587J8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KHDC3LQ587J8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KHDC3LQ587J8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms