Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF394Q53GI3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms