Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC23Q53EV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC23Q53EV4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms