Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FNDC3BQ53EP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms