Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PKDCCQ504Y2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKDCCQ504Y2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms