Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf46Q504U0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms