Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTXN3Q4LDR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTXN3Q4LDR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTXN3Q4LDR2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTXN3Q4LDR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTXN3Q4LDR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTXN3Q4LDR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTXN3Q4LDR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTXN3Q4LDR2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms